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学术文章丨新型量子点探针结合数字PCR赋能肺炎克雷伯菌精准检测

发布日期:2026-02-09

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近日,首都儿科研究所袁静团队联合多家单位在国际期刊《ACS Sensors》(影响因子IF 9.1)发表题为“Absolute Quantitative Detection of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae Using a Novel Silicon-Doped Carbon Quantum Dot Probe-Graphene Oxide”的学术论文。论文第一作者为黄丽娟该研究针对肺炎克雷伯菌临床检测中传统方法成本高、稳定性差、难以区分毒力菌株的核心痛点,创新研发了硅掺杂碳量子点-探针-氧化石墨烯(Si-QD-probe-GO)检测体系,并基于新羿生物微流控数字PCR(dPCR)技术,建立了兼具高灵敏度、高特异性的肺炎克雷伯菌绝对定量与毒力分型检测方法,为临床感染精准诊断提供了全新技术方案。


研究背景


肺炎克雷伯菌(Kpn)是临床常见的条件致病菌,广泛存在于人体肠道、呼吸道及医疗设备表面,可引发肺炎、肝脓肿、尿路感染等多种感染,每年导致全球多达17.6万人死亡。根据毒力差异,其可分为经典型(cKpn)和高毒力型(hvKpn),其中hvKpn不仅易引发侵袭性感染,还可感染健康人群,对公共卫生构成重大威胁。

传统检测方法存在显著局限:培养法作为金标准耗时冗长;常规实时荧光定量PCR(RT-qPCR)依赖的TaqMan探针存在光漂白严重、稳定性差、成本高昂等问题;质谱法仍需培养步骤,酶联免疫吸附试验(ELISA)存在交叉反应和灵敏度不足的缺陷。因此,开发一种快速、精准、稳定的肺炎克雷伯菌检测与毒力分型技术,成为临床诊断领域的迫切需求。



研究目的


构建新型Si-QD-probe-GO检测体系,实现“定量检测+毒力区分”双重目标:

● 合成硅掺杂碳量子点(Si-QDs)并与单层氧化石墨烯(GO)结合,替代传统 TaqMan探针的荧光团和淬灭剂,解决传统探针的技术瓶颈;

● 设计靶向khe(保守基因,用于定量)、iucA和peg-344(毒力标记基因,用于分型)的特异性探针阵列;

● 优化检测条件,验证该体系结合dPCR技术的灵敏度、特异性及临床适用性,实现肺炎克雷伯菌的绝对定量检测与cKpn/hvKpn精准区分。



研究方法


本研究通过一步水热法合成Si-QDs,采用改良Hummers法制备GO并进行氨基修饰,构建Si-QD-probe-GO复合物;设计针对khe、iucA、peg-344基因的引物与探针,优化Si-QDs与GO比例、探针长度、反应pH、温度等关键条件;以肺炎克雷伯菌标准株及其他11种常见致病菌为研究对象,验证方法的特异性;通过梯度浓度菌液检测评估灵敏度;建立小鼠肺炎模型,收集不同时间点肺组织样本,对比该方法与传统培养法的检测一致性。



研究结果


※ 特异性:100%区分目标菌株与毒力分型
基于khe、iucA、peg-344基因的探针阵列对13种细菌的检测结果显示,仅肺炎克雷伯菌可使Si-QD-probe(khe)-GO产生特异性荧光信号,iucA和peg-344探针可精准识别hvKpn。结合偏最小二乘判别分析(PLS-DA)模型,实现非肺炎克雷伯菌与Kpn的100%分类,以及cKpn与hvKpn的无误差区分

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 灵敏度:最低检出限达5 CFU/mL
Si-QD-probe-GO结合dPCR技术,以khe基因为靶点时,肺炎克雷伯菌检测限低至5 CFU/mL,显著优于传统TaqMan探针(10² CFU/mL);在10²-10⁵CFU范围内线性关系良好(R²=0.9871),批内变异系数仅0.32%-2.19%,定量准确性与重复性优异。探针在-20℃储存6个月后,检测限仍可达到8 CFU/mL

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 临床适用性:小鼠模型验证与传统方法高度一致

在小鼠肺炎模型中,该方法检测肺组织样本的Kpn载量与传统平板计数法结果呈强相关性(R²=0.8090,P<0.001),能精准反映细菌在肺内的增殖与清除动态(24h增殖达峰值,14天基本清除)。病理切片显示,hvKpn NTUH-2044感染组肺组织损伤较cKpn W14组更严重,与PLS-DA模型的毒力分型结果完全吻合


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总结与讨论


本研究创新开发的Si-QD-probe-GO检测体系,彻底解决了传统荧光探针成本高、稳定性差、光漂白严重的技术痛点,结合dPCR技术实现了肺炎克雷伯菌的绝对定量检测与毒力分型一体化。该技术不仅为肺炎克雷伯菌感染的早期诊断、疗效监测提供了可靠工具,其设计理念还可为其他致病性细菌的检测平台开发提供参考,具有广阔的临床应用前景。


原文链接:

https://doi.org/10.1021/acssensors.5c00508



●关于新羿生物●

新羿生物成立于2015年,位于中关村科技园,是国家高新技术企业、北京市“专精特新”企业,专注于生命科学与分子诊断的自主创新,拥有在仪器、芯片、材料、试剂、软件等领域的高水平研发团队。公司发展迅速,申请国内外专利200余项、授权专利150余项,持续在权威期刊发表学术论文,承担国家级科研基金。公司基于自主知识产权的数字PCR技术,已获得首个及第二个共三项数字PCR仪NMPA III类医疗器械注册证,三项诊断试剂NMPA III类医疗器械注册证,其中感染和实体瘤液体活检领域均为首个数字PCR诊断试剂III类注册证,两次获得中国体外诊断优秀创新产品金奖,荣获中关村国际前沿科技创新大赛总冠军,荣获北京市科学技等奖和发明创业成果奖。公司自主研发的开放式分子POCT一体机及qPCR快检试剂均获NMPA III类医疗器械注册证。公司秉承“创新,让精准触手可及”的理念,发展多指标、高通量、自动化、防污染、成本低的先进技术,致力于成为领先的生命科学和分子诊断企业,服务于生命科学、精准医疗、药物开发及健康管理。