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学术文章丨北京佑安医院科研团队建立丁肝病毒检测新方法

发布日期:2022-09-05

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乙肝病毒(HBV)感染者部分会同时感染丁肝病毒(HDV),对HDV的及时、准确检测是制定科学治疗方案和实现临床治愈的前提。首都医科大学附属北京佑安医院任锋教授团队基于数字PCR平台上开发了一种高敏可靠的HDV检测方法,论文发表在国际期刊《Clinical and Translational Gastroenterology》上。

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灵敏度和线性范围验证


研究者以含有HDV全基因序列的质粒和WHO的HDV标准品为检测对象,验证和对比了数字PCR法和RT-PCR法的检测下限、定量下限和线性范围。结果显示,数字PCR法对含HDV基因序列质粒的检测下限是10拷贝/微升(图a),线性范围是10-10拷贝/微升(图b);对WHO的HDV标准品的检测下限是5.75 IU/毫升,在5.75-5750 IU/毫升浓度范围内有比较好的线性关系(图d)。RT-PCR法与之相对应的分别是质粒检测下限10³拷贝/微升,线性范围是10³-10拷贝/微升(图c),WHO标准品的检测下限是575 IU/毫升(图d)。


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研究者又以30HBVHDV共感染者和14HBV单独感染者的共44个血液样本为研究对象,分别验证了数字PCR法和RT-PCR法的检出率(HDV感染阳性是以抗HDVIgGElisa检测结果为判断标准)。实验结果显示,30HDV阳性样本中,数字PCR法检出24个,RT-PCR法检出10个(图a);14HBV单独感染样本两种方法都未检出(图b)。这些感染者都接受了抗病毒药物治疗,这可能影响了HDV核酸的检出率。


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对四种不同HBV相关疾病患者样本的HDV检测


研究者对各182名慢性乙肝(CHB)、肝硬化(LC)、肝细胞癌(HCC)和肝衰竭(LF)患者,共728个样本进行了抗HDV的IgG和IgM检测,共检出了26个抗HDV 的IgG阳性,其中9个抗HDV的IgM阳性。然后,研究者又分别用RT-PCR和数字PCR对26个抗HDV 的IgG阳性样本进行了HDV的核酸检测,结果显示数字PCR检出了9个阳性,与抗HDV的IgM检测结果一致;而RT-PCR法检出4个阳性(见下图)。


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从实验结果可以看出,相较于RT-PCR法,数字PCR法有更高的检出率,而且与IgM抗体检测有着较高的一致性。原因可能是人体的IgM一般在病毒感染的早期产生,中期消失被IgG取代,与病毒核酸在人体内存在周期有较高的重叠。此外,不同HBV相关疾病患者样本的HDV核酸不同检出率也表明HDV和HBV合并感染可显著加速肝病的进展。


数字PCR法检测结果的重复性


研究者还对数字PCR法进行了不同样本的批次间重复性和批次内重复性验证,结果都显示了比较好的稳定性,结果请见下图:

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总结


任峰教授科研团队研发的数字PCR HDV检测方法展现了极高的检测灵敏度和稳定性,并且进一步提示HDV和HBV合并感染与HBV相关疾病发展的相关性。新羿生物祝贺任峰教授取得的研究成果,并期待数字PCR技术在更多科学研究中发挥作用!

原文链接:https://doi.org/10.14309/ctg.0000000000000509